随着我国经济的发展与人民生活水平的提高，人们愈发注重健康食品的采购。对食品质量问题的关注度越来越高。不同微生物会导致食品出现腐化、传播疾病等现象，因此微生物检测技术的应用对于提高食品安全性具有重要作用。利用微生物检测技术判断食品是否可以食用，并准确判断食品污染程度、食品加工环境等，提高卫生检查工作的质量与效率，防止食品中微生物引起的各类疾病。

通过食品微生物检测，可以对食源性病原菌和有害微生物检测分析，确保整个供应链中食品产品的持续安全性，协助企业分析产品污染源、分离优势菌种等等。

中科检测开展微生物检验的重点食品种类为：

奶制品、罐头食品、调味品、蛋制品、淀粉类制品、发酵和非发酵性豆制品、冷冻饮品、糖果、饮用天然矿泉水等，其中食糖以及保健品的微生物检验为我国所独有。 

食品微生物检测标准：

GB 4789.2-2016 食品安全国家标准 食品微生物学检验 菌落总数测定

GB 4789.3-2016 食品安全国家标准 食品微生物学检验 大肠菌群计数

GB 4789.15-2016 食品安全国家标准 食品微生物学检验 霉菌和酵母计数

GB 4789.4-2016 食品安全国家标准 食品微生物学检验 沙门氏菌检测

GB 4789.10-2016 食品安全国家标准 食品微生物学检验 金黄色葡萄球菌检验

GB 4789.30-2016 单核细胞增生李斯特氏菌检验

食品的菌落总数严重超标，说明其产品的卫生状况达不到基本的卫生要求。卫生质量标准是：在加工、贮藏运输过程中是否受到污染。卫生学指标：菌落总数和致病菌有本质区别，必须配合其他病原菌项目的检验，才能作出比较全面准确的评定。

中科检测展开评估原料、半成品食品、最终产品和流程的安全性和功效。