菌种鉴定的方法一般有常规鉴定和分子生物学方法:
(1)常规鉴定:菌落形态观察、革兰氏染色、菌毛染色、糖类分解实验、吲哚实验、淀粉水解实验、V-P实验、甲基红实验、柠檬酸盐利用实验、硝酸盐还原实验、接触酶实验等
(2)分子生物学方法:细菌16SrDNA菌种鉴定:提取DNA,特定引物PCR扩增,PCR产物纯化测序,进化树分析;真菌18S rDNA/ITS菌种鉴定流程也是一样的。
鉴定方法 | 涉及菌种 |
rDNA(核糖体DNA)序列分析 | 细菌、放线菌、酵母、霉菌 |
大型丝状真菌 | |
功能基因分析 | 乳杆菌、双歧杆菌、肠球菌 |
pheS,gyrB,gyrA,atpD等 | 芽孢杆菌 |
生理生化分析 | 细菌、放线菌、酵母 |
BioLog分析 | 细菌、酵母 |
API | 细菌、酿酒酵母 |
形态学分析 | 霉菌 |
1、2分别与3、4、5组合 | 细菌、放线菌、酵母、霉菌 |
大型丝状真菌 | |
G+C mol%含量测定 | 细菌、放线菌、酵母 |
脂肪酸组分分析 | 细菌、放线菌、酵母 |
DNA-DNA杂交 | 细菌、放线菌、酵母 |
极性脂 | 细菌、放线菌 |
呼吸醌 | 细菌、放线菌 |
电子显微镜 | 细菌、放线菌、酵母、霉菌 |
| 产品名称 | 检测标准 | 检测项目 |
| 菌种鉴定及分析 | 功能基因分析,rDNA(核糖体DNA)序列分析 | 形态学分析、脂肪酸组分分析 |
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